En el mercado, existen diversos preparados de hormonas tiroideas para tratar el hipotiroidismo, como preparados sintéticos de T4 (levotiroxina), de T3 (liotironina), combinaciones de las dos hormonas sintéticas y extracto tiroideo disecado de animal.

En el hipotiroidismo primario, el preparado más utilizado es la levotiroxina, por su potencia uniforme. El tratamiento se inicia con dosis bajas, en especial en ancianos, y se ajusta la dosis cada 6 semanas hasta lograr la dosis de mantenimiento, que será la mínima necesaria para normalizar las concentraciones séricas de TSH y que puede tenerse que reducir en ancianos y aumentar durante el embarazo.

En los pacientes con hipotiroidismo secundario, no debe administrarse levotiroxina hasta que se confirme una secreción adecuada de cortisol. En el caso que éste sea insuficiente, deberá administrarse concomitantemente, para evitar que la levotiroxina precipite una crisis suprarrenal.

En el caso del coma mixedematoso, se administrarán levotiroxina por vía intravenosa y corticoides, y se instaurarán las medidas de sostén según sea necesario.